ความซับซ้อนของโรคมะเร็งสามัญที่มีรายละเอียดในการวิเคราะห์จีโนมอย่างกว้างขวาง

A massive undertaking involving more than 1,300 scientists from 37 countries reported in 23 papers shows the results of analyzing 47 million genetic changes in 2,600 genomes of 38 different tumor types. กิจการขนาดใหญ่ที่เกี่ยวข้องกับนักวิทยาศาสตร์มากกว่า 1,300 คนจาก 37 ประเทศที่รายงานใน 23 เอกสารแสดงผลการวิเคราะห์การเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรม 47 ล้านครั้งใน 2,600 จีโนมจาก 38 ชนิดของเนื้องอกที่แตกต่างกัน The Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes (PCAWG) presented what the researchers called “the most comprehensive study of whole cancer genomes to date.” การวิเคราะห์มะเร็งทั่วทั้งจีโนม (PCAWG) นำเสนอสิ่งที่นักวิจัยเรียกว่า "การศึกษาที่ครอบคลุมมากที่สุดของจีโนมมะเร็งทั้งหมดจนถึงปัจจุบัน"
นักวิจัยแบ่งออกเป็น 16 คณะทำงานเปิดประตูสู่ความซับซ้อนทางพันธุกรรมและโรคทั่วไปในมะเร็งและนำเสนอข้อมูลเชิงลึกที่สามารถกระตุ้นการค้นพบและการรักษาในที่สุด
PCAWG analyzed whole genomes rather than the more common approach of sequencing only protein-coding regions. PCAWG วิเคราะห์จีโนมทั้งหมดแทนที่จะใช้วิธีการทั่วไปในการจัดลำดับเฉพาะบริเวณที่มีการเข้ารหัสโปรตีน They produced 1,188 tumor transcriptomes to link RNA and DNA alterations and explored genetic drivers, tumor signatures, and virus DNA found in cancers. พวกเขาผลิต transcriptomes เนื้องอก 1,188 ตัวเพื่อเชื่อมโยงการเปลี่ยนแปลงของ RNA และ DNA รวมถึงการสำรวจไดรเวอร์พันธุกรรมลายเซ็นมะเร็งและ DNA ไวรัสที่พบในมะเร็ง These analyses generated more than 800 terabytes of data, roughly equivalent to the storage required for 200,000 movies. การวิเคราะห์เหล่านี้สร้างข้อมูลมากกว่า 800 เทราไบต์ซึ่งเทียบเท่ากับพื้นที่จัดเก็บข้อมูลที่จำเป็นสำหรับภาพยนตร์ 200,000 เรื่อง
PCAWG found cancer-driver mutations for 95% of cases, and that on average each cancer genome has four or five drivers. PCAWG พบการผ่าเหล่าของตัวขับมะเร็ง 95% ของผู้ป่วยและโดยเฉลี่ยแล้วจีโนมมะเร็งแต่ละตัวมีไดรเวอร์สี่หรือห้าตัว Sizable minorities of cancers showed signs of chromoplexy (17.8%) or chromothripsis (22.3%), reflecting complex and chaotic rearrangement processes. ชนกลุ่มน้อยที่มีขนาดใหญ่ของโรคมะเร็งมีสัญญาณของ chromoplexy (17.8%) หรือ chromothripsis (22.3%) สะท้อนให้เห็นถึงกระบวนการจัดเรียงที่ซับซ้อนและวุ่นวาย The researchers found that genetic changes leading to cancer occur early on—sometimes decades in advance of diagnosis. นักวิจัยพบว่าการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมที่นำไปสู่โรคมะเร็งเกิดขึ้นในช่วงต้น - บางครั้งหลายทศวรรษในการวินิจฉัยล่วงหน้า
The investigation also uncovered genetic drivers in noncoding DNA, like noncoding regions of the tumor-suppressor gene TP53 and of the telomerase gene TERT. การตรวจสอบยังค้นพบโปรแกรมควบคุมทางพันธุกรรมใน DNA ที่ไม่มีการเข้ารหัสเช่นบริเวณที่ไม่มีการเข้ารหัสของ TP53 ยีนของยีนต้านมะเร็งและ TERT ของยีน telomerase Another PCAWG team characterized mutational signatures using more than 84 million somatic mutations from 4,645 whole-genome and 19,184 exome sequences to describe 81 signatures including single- doublet- and clustered-base-substitutions as well as small insertion-and-deletion signatures, many not previously identified. ทีม PCAWG อีกทีมหนึ่งมีลักษณะการกลายพันธุ์โดยใช้การกลายพันธุ์มากกว่า 84 ล้านตัวจาก 4,645 ทั้งจีโนมและ 19,184 ลำดับที่แปลกใหม่เพื่ออธิบาย 81 ลายเซ็นรวมถึงการแทนที่แบบเดี่ยว - คู่ - และ - คลัสเตอร์ - ลบขนาดเล็กจำนวนมาก ระบุไว้ก่อนหน้านี้ In a first, another team identified 16 structural variants involving large rearrangements. ในครั้งแรกทีมอื่นระบุ 16 สายพันธุ์โครงสร้างที่เกี่ยวข้องกับการจัดเรียงใหม่ขนาดใหญ่
การวิเคราะห์ไวรัสที่เกี่ยวข้องกับมะเร็งเน้นความชุกของ Epstein-Barr ไวรัสไวรัสตับอักเสบบีและ papillomavirus มนุษย์
All the PCAWG papers, published in Nature and related journals, are open access at nature.com/collections/afdejfafdb. เอกสาร PCAWG ทั้งหมดที่เผยแพร่ใน Nature และวารสารที่เกี่ยวข้องสามารถเข้าถึงได้ที่ nature.com/collections/afdejfafdb The researchers' raw genome sequencing data and other resources also are available to researchers. ข้อมูลลำดับจีโนมดิบของนักวิจัยและแหล่งข้อมูลอื่น ๆ ยังมีให้สำหรับนักวิจัย
พิษที่เกิดขึ้นอย่างฉับพลันที่กำลังเกิดขึ้นในเด็กวัยรุ่น
About one-quarter of opioid poisonings occur in children and adolescents, and poisoning incidents have become more severe in recent years, according to an abstract presented at the Society of Critical Care Medicine's annual congress. ประมาณหนึ่งในสี่ของการเกิดพิษ opioid เกิดขึ้นในเด็กและวัยรุ่นและเหตุการณ์พิษได้ทวีความรุนแรงมากขึ้นในช่วงไม่กี่ปีที่ผ่านมาตามรายงานที่นำเสนอในการประชุมประจำปีของสมาคมการแพทย์วิกฤตการแพทย์ที่สำคัญ The retrospective study of more than 750,000 opioid poisoning cases reported to the National Poison Data System from 2005 to 2018 found that 27.5% (207,543) of cases occurred in patients younger than age 19. การศึกษาย้อนหลังของผู้ป่วย opioid พิษมากกว่า 750,000 รายได้รายงานไปยังระบบข้อมูลพิษแห่งชาติ 2548-2561 พบว่า 27.5% (207,543) ของผู้ป่วยอายุน้อยกว่าอายุ 19
Trend analysis over three eras (2005–2009, 2010–2014, and 2015–2018) showed that the percentage of patients admitted to critical care units and deaths increased over time; การวิเคราะห์แนวโน้มมากกว่าสามยุค (2548-2552, 2553-2557 และ 2558-2561) แสดงให้เห็นว่าร้อยละของผู้ป่วยที่เข้ารับการรักษาที่หน่วยดูแลที่สำคัญและการเสียชีวิตเพิ่มขึ้นเมื่อเวลาผ่านไป; 6.6%, 8.5%, and 9.6% and 0.18%, 0.20%, and 0.28%, respectively. 6.6%, 8.5% และ 9.6% และ 0.18%, 0.20% และ 0.28% ตามลำดับ The probability of having a moderate or major effect also rose, by 0.55% and 0.11%, respectively. ความน่าจะเป็นของการมีผลกระทบปานกลางหรือที่สำคัญก็เพิ่มขึ้นเช่นกัน 0.55% และ 0.11% ตามลำดับ
Opioid พิษที่มีความตั้งใจฆ่าตัวตายเพิ่มขึ้นในช่วงเวลาสามช่วงเวลาจาก 13.9% เป็น 21.2%
ในรายงานที่ตีพิมพ์แยกต่างหากนักวิจัยกล่าวว่าพวกเขาสังเกตเห็นการแจกแจงอายุสูงสุดสองครั้งสำหรับพิษ opioid ในเด็กตั้งแต่แรกเกิดถึงอายุ 4 และในวัยรุ่นตั้งแต่ 15 ถึง 19 ปี
แผนกฉุกเฉินสำหรับผู้ป่วยนอกที่ได้รับการยกเว้นจาก EMBOLISM
Computed Tomographic pulmonary angiography (CTPA) ถูกใช้มากเกินไปในการวินิจฉัยการทำงานของ pulmonary embolism (PE) โดยเน้นย้ำ“ ความต้องการเร่งด่วนสำหรับการเผยแพร่และการใช้งานโปรโตคอลเพื่อลดการสแกน CTPA ที่ให้ผลผลิตต่ำ” รวมถึงการทดสอบ D-dimer ของการศึกษาตรวจสอบการปฏิบัติฉุกเฉินของแผนก (ED) ที่เกี่ยวข้องกับการทดสอบที่เกี่ยวข้องกับ PE (Circ Cardiovasc Qual Qual 2020, 13: e005753)
The study, a cross-sectional analysis of electronic health record and billing data from 16 EDs in Indiana and 11 hospitals in the Dallas-Fort Worth area, identified ED patients who underwent any of the following, including D-dimer testing, CTPA, scintillation ventilation perfusion lung scanning, or pulmonary angiography. การศึกษานี้เป็นการวิเคราะห์แบบตัดขวางของบันทึกข้อมูลสุขภาพอิเล็กทรอนิกส์และข้อมูลการเรียกเก็บเงินจาก 16 EDs ในรัฐอินเดียนาและโรงพยาบาล 11 แห่งในพื้นที่ดัลลัส - ฟอร์ตเวิร์ ธ ระบุผู้ป่วยโรค ED ที่ได้รับ การสแกนการกระจายของปอดกระจายหรือการขยายหลอดเลือด angiography Out of 1.83 million patient encounters, 5.3% had a diagnostic test for PE. จากการพบผู้ป่วย 1.83 ล้านคน 5.3% มีการทดสอบวินิจฉัยสำหรับ PE Nearly 60% of all patients who had tests for PE underwent CTPA without D-dimer testing. เกือบ 60% ของผู้ป่วยทั้งหมดที่ได้รับการทดสอบ PE ได้รับ CTPA โดยไม่มีการทดสอบ D-dimer About 21% of CTPA took place in women younger than age 45, who are at greater risk of cancer from CTPA radiation exposure, according to the authors. ประมาณ 21% ของ CTPA เกิดขึ้นในผู้หญิงอายุน้อยกว่า 45 ปีซึ่งมีความเสี่ยงต่อการเกิดมะเร็งจากการได้รับรังสี CTPA
อัตราการวินิจฉัยรวมของ CTPA สำหรับ PE อยู่ที่ 3.1% โดยมีอัตรา 1.3% ใน Indiana EDs และอัตรา 4.8% ในโรงงาน Dallas-Fort Worth
ผู้ป่วยในรัฐอินเดียนามีโอกาสน้อยกว่าผู้ที่อยู่ในเมืองดัลลัส - ฟอร์ตเวิร์ ธ เพื่อรับการทดสอบ D-dimer ก่อน CTPA (30% เทียบกับ 52% ตามลำดับ) อาจสะท้อนถึงผลกระทบของโครงการปรับปรุงคุณภาพ เพื่อเพิ่มการใช้การทดสอบ D-dimer ในผู้ป่วยที่มีความเสี่ยงต่ำ
The data imply that “D-dimer ordering correlates with an increased yield rate of PE on CTPA,” wrote the investigators. ข้อมูลบ่งบอกว่า“ การสั่งซื้อ D-dimer สัมพันธ์กับอัตราผลตอบแทนที่เพิ่มขึ้นของ PE บน CTPA” นักวิจัยกล่าว “This relationship suggests but does not prove a positive cause-effect relationship between rate of D-dimer ordering and PE yield.” “ ความสัมพันธ์นี้แสดงให้เห็น แต่ไม่ได้พิสูจน์ความสัมพันธ์เชิงบวกระหว่างสาเหตุของอัตราการสั่งซื้อ D-dimer และผลผลิต PE”